Sljedeći tečajevi
Naziv tečaja: DNA i RNA
1. termin: 22.-26. ožujka 2010.
rok za prijavu 1. ožujka 2010.
2. termin: 19.-23. travnja 2010.
rok za prijavu 29. ožujka. 2010.
Predavači:
Dr. sc. Koraljka Gall Trošelj: Izdvajanje DNA
Dr. sc. Silva Katušić Hećimović: Lančana reakcija polimerazom (PCR)
Dr. sc. Tatjana Bordukalo Nikšić: Izdvajanje RNA, Reverzna transkripcija i PCR (RT-PCR)
Dr. sc. Helena Ćetković: Određivanje slijeda nukleotida i analiza
Dr. sc. Brankica Mravinac, dr. sc. Nevenka Meštrović Radan: Kloniranje odsječka PCR u plazmidni vektor
Dr. sc. Neda Slade: Real-Time PCR
OPIS TEČAJA: Ovaj tečaj obuhvaća osnovne metode rada s DNA i RNA gdje polaznici, uz nadzor znanstvenika, sami izvode eksperimente. Prvi korak će biti izdvajanje DNA iz tkiva metodom s fenol/kloroformom, dok će se izdvajanje RNA provoditi pomoću guanidin izotiocijanata i kisele fenolne ekstrakcije. Nadalje, polaznici će naučiti metodu lančane reakcije polimerazom (PCR) kojom mogu analizirati izdvojenu DNA. Za analizu ekspresije gena naučit će metodu PCR nakon reakcije reverzne transkripcije (RT-PCR). Dobit će teoretske osnove o korištenju metode PCR u realnom vremenu (Real Time PCR) koja je važna za kvantitativnu analizu ekspresije gena. Zatim će polaznici provesti pripremu uzorka DNA za određivanje slijeda nukleotida (sekvenciranje), kako se to radi u DNA servisu na Institutu Ruđer Bošković. Naposljetku, naučit će kako klonirati odsječak PCR u plazmidni vektor i time zaokružiti svoje osnovno znanje o DNA i RNA analizama.
Raspored sati
| ponedjeljak | utorak | srijeda | četvrtak | petak |
|---|---|---|---|---|
| 9.00-9.30 KAVA, upoznavanje sa programom | 9.00-10.00 Kloniranje odsječka PCR u plazmidni vektor | |||
| 9.30-11.30 Izdvajanje DNA Izdvajanje RNA (predavanja) | 8.30-10.30 Izdvajanje DNA | 9.00-11.00 RT-PCR | 10.30-12.00 Sekvenciranje i analiza sekvence (predavanje) | 8.00-10.30 Kloniranje odsječka PCR u plazmidni vektor |
| 11.30-13.00 Izdvajanje RNA | 10.30-13.30 Izdvajanje RNA | 11.00-13.00 Kloniranje odsječka PCR u plazmidni vektor | 12.00-12.30 prezentacija POLO PLUS | 10.30-12.30 Sekvenciranje i analiza sekvence |
| ručak 13.00-14.00 | ručak 13.30-14.30 | ručak 13.00-14.00 | ručak 12.30-13.30 | ručak 12.30-13.30 |
| 14.00-14.30 prezentacija GOREA PLUS | 14.30-15.30 Kloniranje (predavanje) | 14.00-17.00 PCR | 13.30-16.30 PCR | 13.30-16.00 Sekvenciranje i analiza sekvence |
| 14.30-17.30 Izdvajanje DNA | 15.30-18.30 Kloniranje odsječka PCR u plazmidni vektor | 17.00-18.30 Real-Time PCR (predavanje) | 16.30-19.00 Sekvenciranje i analiza sekvence | 16.00-18.00 završna riječ, cheese and wine |
| 17.30-19.00 PCR, RT-PCR (predavanje) | 16.00-18.00 završna riječ, cheese and wine |
Cijena po polazniku:
4620 kn* (tečaj 3800 kn + priručnik «Metode u molekularnoj biologiji» po kojem se na tečaju radi 820 kn).
*Oni koji su već nabavili priručnik ili ga ne žele kupiti plaćaju samo cijenu tečaja 3800 kn. Oni koji ne kupe priručnik, za vrijeme rada u laboratoriju, dobit će ga na posudbu.
U cijenu su uključeni svi materijalni troškovi i ručak tijekom pet dana tečaja.
Naziv tečaja: Stanice i proteini
Vrijeme održavanja:
10.-14. svibnja 2010. – rok za prijavu 19. travnja 2010.
Predavači:
| Dr. sc. Andreja Ambriović Ristov: | Kultura stanica; ELISA |
| Dr. sc. Anamaria Brozović: | SDS-PAGE i Western blot; Metode mjerenja citotoksičnosti |
| Dr. sc. Mariastefania Antica: | Ekspresija površinskih molekula protočnom citometrijom |
| Dr. sc. Maja Herak Bosnar: | SDS-PAGE I Western blot; Transfekcija gfp fuzijskog proteina |
| Dr. sc. Neda Slade: | Imunocitokemija/Imunofluorescencija; Utvrđivanje i mjerenje apoptoze |
OPIS TEČAJA: Ovaj tečaj obuhvaća osnovne metode rada s stanicama i proteinima gdje polaznici, uz nadzor znanstvenika, sami izvode eksperimente. Rad u laboratoriju započinje nasađivanjem trajne kulture stanica za eksperimente koji slijede. Polaznici će naučiti metodu SDS-PAGE i Western blot za analizu ekspresije proteina. Metoda ELISA bit će predstavljena kroz predavanje o tome kako ju uhodati u vlastitom laboratoriju. Polaznici će naučiti kako optimizirati transfekciju za pojedini tip stanica u kulturi i kako transficirati stanice plazmidom koji eksprimira gfp. Uspješnost ovako izvedene transfekcije analizirat će se fluorescentnim mikroskopom. Sljedeća metoda za analizu ekspresije površinskih proteina je protočna citometrija. Polaznici će sami obilježiti stanice specifičnim protutijelom i analizirati rezultate protočnim citometrom. Posljednja metoda analize ekspresije proteina je imunocitokemija. Iako će polaznici u laboratoriju ovu metodu izvesti s trajnom kulturom stanica, kroz predavanje će saznati kako ovu metodu izvesti i na tkivnim prerezima. Ovaj tečaj uključuje i predavanje s pregledom metoda za mjerenje citotoksičnosti (MTT, WST, klonalni rast). Naposljetku, polaznici će naučiti kako utvrditi i mjeriti apoptozu uz pomoć Aneksin-V i time zaokružiti svoje osnovno znanje o metodama rada s kulturama stanica i proteinima.
Raspored sati:
| ponedjeljak | utorak | srijeda | četvrtak | petak |
|---|---|---|---|---|
| 9.00 -9.30 KAVA, upoznavanje sa programom | ||||
| 9.30-10.15 Kultura stanica (predavanje) | 9.00-10.30 SDS-PAGE i Western blot | 9.30-10.00 SDS-PAGE i Western blot | 9.00-10.30 Imunocitokemija i imunohistokemija (predavanje) | |
| 10.15-11.00 Transfekcija (predavanje) | 10.30-12.00 Transfekcija | 10.00-12.00 Protočna citometrija | 10.30-11.00 GOREA PLUS | 9.00-10.30 Metode mjerenja citotoksičnosti |
| 11.00-13.00 Kultura stanica | 12.00-13.30 SDS-PAGE i Western blot | 12.00-12.30 SDS-PAGE i Western blot | 11.00-13.00 Imunocitokemija i imunohistokemija | 10.30-13.30 Imunocitokemija i imunohistokemija |
| 13.00-14.00 Ručak | 13.30-14.30 Ručak | 12.30-13.30 Ručak | 13.00-14.00 Ručak | 13.30-14.30 Ručak |
| 14.00-15.00 SDS-PAGE i Western blot | 14.30-15.00 SDS-PAGE i Western blot | 13.30-16.30 Protočna citometrija | 14.00-18.00 Utvrđivanje i mjerenje apoptoze | 14.30-16.00 Kultura stanica i transfekcija |
| 15.00-16.00 ELISA (samo predavanje) | 15.00-15.30 Transfekcija | 16.30-18.30 SDS-PAGE i Western blot | završna riječ, cheese and wine 16.00-18.00 | |
| 16.00-17.30 SDS-PAGE i Western blot | 15.30 -16.00 POLOPLUS | |||
| 16.00-17.30 Protočna citometrija (predavanje) |
Cijena po polazniku:
4820 kn* (tečaj 4000 kn + priručnik «Metode u molekularnoj biologiji» po kojem se na tečaju radi 820 kn). U cijenu su uključeni svi materijalni troškovi i ručak tijekom tri dana tečaja.
*Oni koji su već nabavili priručnik ili ga ne žele kupiti plaćaju samo cijenu tečaja 4000.00 kn.